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?seqmanのプライマウォーキング機能?のギャップをカバー運転または低カバレッジの領域での最適なプライマー場所を識別します。?
この例では、私はすでに、??contig組み立てと?私はカバレッジを向上する必要がある領域をチェックします。
私は戦略??ビューでは、連続で開始されます。 私は?連続でシングルをクリックし、[連続、戦略ビューを選択します。
この?連続したトレースファイルは、?連続の両端が、すべてのアッパおよびロアストランドと重なっています。 ?
太い緑のエリア、と述べた。しきい値を超えた、シンシアンブルーエリア単一方向カバレッジの表示、シン赤の領域シングルストランド範囲を表します。
は、プライマウォーキングセットアップパラメータを表示するには、私は連続を選択し'll?プライマー、歩いてます。?
私は通信可能範囲プライマーを検索し、私は適用範囲?]ラジオボタンをクリックして向上させることができようにする。 私はまた、?同じストランドにはシーケンスカバレッジの領域では、プライマープライマーを排除するためにします。?
したがって、私は、クローン範囲?チェックボックスをオンにします? 私は、デフォルトで他のすべてにして、?[OK]をクリックします必要があり'll]をクリックします。
?seqman?シーケンスを検索した後プライマー、?プライマウォーキングレポートが表示されます。
整列ビューには、最上位??得点プライマは、を参照してくださいするには、I-ダブルクリックし'll。??ここから、私は戦略?ビューをもう一度?連続、戦略]を選択して開くことができます。??
?カバレッジのしきい値グラフの下には、細い赤水平線??下ストランドシーケンスプライマーに対応します。
最後に、私は私の??入門情報を保存します。 最初に、私は、?プライマレポートが?表示するのに徒歩圏内のをクリックします。
そして、私はファイル]メニューに移動し、保存?プライマー情報を選択します。 ?
私のファイル??tab-separatedテキストとして保存しようと思っている。 ?
後で、私は、ファイルをMicrosoft Excelなど、?任意のテキストビューアとしてを使用して開くことができます。
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